Alchemia rządzi się prawem równomiernej wymiany coś za coś. Dwoje młodych braci Erlic- Edward i Alphonse zrozumieli to po próbie zakazanego aktu w alchemii- transmutacji człowieka. Zapłacili za to straszną sumę, Edward stracił swoją lewą nogę, a Alphonse jego fizyczne ciało. Jedynie poprzez desperackie poświęcenie swojej ręki Edward był w stanie zapieczętować duszę swojego brata w zbroi. Zdruzgotani i samotni mają nadzieję, że obaj powrócą do poprzedniego stanu co zainspirowało Edwarda do zdobycia metalowych protez zwanych "automail" i stanowiska państwowego alchemika. Tak oto stalowy alchemik i jego brat rozpoczynają poszukiwania swoich ciał.