Fabuła anime koncentruje się na Kanako Miyamae, uczennicy, która podążając drogą swojej matki przenosi się do katolickiej szkoły żeńskiej Ame no Kisaki. Ze względu na nietypową przypadłość Kanako nie może znaleźć sobie chłopaka. Niemalże od razu poznaje

Maria Shidou

Marie Shidou, czyli tytułową bohaterkę, która jest idealną kandydatką na partnerkę. Jednak "koleżanka" Kanako skrywa pewien sekret, który komplikuje życie obu dziewczynom. Młodsza o rok Maria chce za wszelką cenę pilnować swojej tajemnicy, więc przeprowadza się do pokoju Kanako w szkolnym internacie. Nowicjuszka ma sprzeczne uczucia co do Maryi oraz ciągle towarzyszącej jej pokojówce, Matsurice Shinouji. Kanako zaprzyjaźnia się w nowej szkole z kilkoma dziewczynami. Razem przeżywają wiele niezapomnianych historii. Jednak jak Miyamae radzi sobie ze swoją przypadłością? Czy znajdzie prawdziwą miłość w szkole?